Existe una demanda de los usuarios para poder utilizar bibliotecas de visualización para poder realizar gráficos de los datos que generan a partir de las simulaciones que realizan en el cluster.

Existen dos posibilidades:

• Utilizan el nodo de login (snmgt01/02) para hacer gráficos sencillos (gnuplot/matplotlib) y redirigen el display via SSH (ssh -X / ssh -Y) para poder ver el output en su equipo local.
• Utilizan un nodo de visualización (vlmgt01/02) para demandas gráficas más intensivas (ovito/vesta/xcrysden) y utilizan un protocolo de comunicación enfocado a este tipo de tareas.

Este documento es un dump donde voy a documentar distintas opciones que testee, ya que a priori no está claro cual es la mejor estrategia o herramienta para ello.

Ya estuve haciendo algunas pruebas antes de comenzar a documentar, por lo que puede que haya algo que se me olvide de agregar.

Estuve usando los nodos que finalizan en 02 para los tests (snmgt02 / vlmgt02). Me gustaría estudiar la posibilidad de hacer una reinstalación de los nodos de visualización para poder revertir los cambios hechos y poder documentarlos mejor. De esta manera, asegurarme que se puede reproducir la instalación en los nodos de visualización y login.

En caso de querer tunelear el display por SSH de forma más sencilla, son necesarias algunas tools de X11 en el nodo.

Estas se pueden instalar con dnf.

dnf install xorg-x11-xauth

Para redigirig el display a la computadora local, hace falta hacer ssh con alguna de las siguientes opciones:

• -XC (untrusted y compressed)
• -YC (trusted y compressed)

ssh -YC -J bbruzzo@172.29.3.3 bbruzzo@172.28.253.12

Se puede testear si está funcionando correctamente con alguna de estas tools (entre otras):

• xeyes
• xclock
• glxgears

Usé iperf3 para medir el bandwith via ssh.

En el nodo destino, en este ejemplo, snmgt02:

iperf3 -s -p 5201

Abrir un túnel desde la sesión local:

ssh -L 6002:localhost:5201 -J bbruzzo@172.29.3.3 bbruzzo@172.28.253.12 -N -f

Lanzar iperf3 desde la sesión local:

iperf3 -c localhost -p 6002

Observamos en la sesión local:

$ iperf3 -c localhost -p 6002
Connecting to host localhost, port 6002
[  5] local ::1 port 39988 connected to ::1 port 6002
[ ID] Interval           Transfer     Bitrate         Retr  Cwnd
[  5]   0.00-1.00   sec  12.1 MBytes   102 Mbits/sec   11    465 KBytes       
[  5]   1.00-2.00   sec  8.00 MBytes  67.1 Mbits/sec   14    465 KBytes       
[  5]   2.00-3.00   sec  7.50 MBytes  62.9 Mbits/sec   10    465 KBytes       
[  5]   3.00-4.00   sec  7.62 MBytes  64.0 Mbits/sec    6    465 KBytes       
[  5]   4.00-5.00   sec  8.62 MBytes  72.3 Mbits/sec   12    625 KBytes       
[  5]   5.00-6.00   sec  7.50 MBytes  62.9 Mbits/sec    7    625 KBytes       
[  5]   6.00-7.00   sec  8.50 MBytes  71.3 Mbits/sec    3    625 KBytes       
[  5]   7.00-8.00   sec  8.75 MBytes  73.4 Mbits/sec    1    625 KBytes       
[  5]   8.00-9.00   sec  6.88 MBytes  57.7 Mbits/sec    6    625 KBytes       
[  5]   9.00-10.00  sec  9.25 MBytes  77.6 Mbits/sec    4    625 KBytes       
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
[ ID] Interval           Transfer     Bitrate         Retr
[  5]   0.00-10.00  sec  84.8 MBytes  71.1 Mbits/sec   74            sender
[  5]   0.00-10.27  sec  82.4 MBytes  67.3 Mbits/sec                  receiver

iperf Done.

Y en la sesión remota que teníamos abierta ahora se observa:

[bbruzzo@snmgt02 ~]$ iperf3 -s -p 5201
-----------------------------------------------------------
Server listening on 5201
-----------------------------------------------------------
Accepted connection from ::1, port 33486
[  5] local ::1 port 5201 connected to ::1 port 33494
[ ID] Interval           Transfer     Bitrate
[  5]   0.00-1.00   sec  7.58 MBytes  63.6 Mbits/sec                  
[  5]   1.00-2.00   sec  8.12 MBytes  68.2 Mbits/sec                  
[  5]   2.00-3.00   sec  8.03 MBytes  67.4 Mbits/sec                  
[  5]   3.00-4.00   sec  8.10 MBytes  68.0 Mbits/sec                  
[  5]   4.00-5.00   sec  8.13 MBytes  68.2 Mbits/sec                  
[  5]   5.00-6.00   sec  8.09 MBytes  67.9 Mbits/sec                  
[  5]   6.00-7.00   sec  8.09 MBytes  67.9 Mbits/sec                  
[  5]   7.00-8.00   sec  8.03 MBytes  67.3 Mbits/sec                  
[  5]   8.00-9.00   sec  8.04 MBytes  67.5 Mbits/sec                  
[  5]   9.00-10.00  sec  7.97 MBytes  66.9 Mbits/sec                  
[  5]  10.00-10.27  sec  2.20 MBytes  69.2 Mbits/sec                  
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
[ ID] Interval           Transfer     Bitrate
[  5]   0.00-10.27  sec  82.4 MBytes  67.3 Mbits/sec                  receiver
-----------------------------------------------------------
Server listening on 5201
-----------------------------------------------------------

TO DO: Explorar formas más fehacientes para testear el bandwith. Ejemplo en la documentación de iperf3.

TurboVNC VirtualGL

Explicar como usar estas herramientas en los nodos de visualización Acelaración por hardware con las GPUs nvidia, etc.

Explicar como se podría limitar el uso de los nodos de visualización a través de slurm, usando PAM, y como podrían hacer los usuarios para hacer ssh a los mismos.

Estaría bueno que puedan directamente hacer ssh <user> viz1.clementinaxxi.org.ar