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Compilar Gadget4
git clone http://gitlab.mpcdf.mpg.de/vrs/gadget4 module purge && ml intel/2023.2.1 openmpi4/4.1.6 fftw/3.3.10 hdf5/1.10.8 cmake/3.24.2 gsl/2.8 cd gadget4 cp Template-Config.sh Config.sh cp Template-Makefile.systype Makefile.systype
En Makefile.systype descomentar SYSTYPE=“Generic-gcc”. Luego editar buildsystem/Makefile.gen.libs:
GSL_INCL = -I/opt/ohpc/pub/apps/gsl/2.8/include GSL_LIBS = -L/opt/ohpc/pub/apps/gsl/2.8/lib FFTW_INCL = -I/opt/ohpc/pub/apps/fftw/3.3.10/include FFTW_LIBS = -L/opt/ohpc/pub/apps/fftw/3.3.10/lib HDF5_INCL = -I/opt/ohpc/pub/libs/intel/hdf5/1.10.8/include HDF5_LIBS = -L/opt/ohpc/pub/libs/intel/hdf5/1.10.8/lib HWLOC_INCL = -I/opt/ohpc/pub/libs/hwloc/include HWLOC_LIBS = -L/opt/ohpc/pub/libs/hwloc/lib
Editar buildsystem/Makefile.comp.gcc:
CPP = mpicxx -std=c++11 # Optimización con Intel (las flags originales son compatibles) OPTIMIZE = -ggdb -O3 -march=native -Wall -Wno-format-security # Vectorización explícita (con AVX) ifeq (EXPLICIT_VECTORIZATION,$(findstring EXPLICIT_VECTORIZATION,$(CONFIGVARS))) CFLAGS_VECTOR += -mavx -fabi-version=0 CPV = $(CPP) else CFLAGS_VECTOR = CPV = $(CPP) endif
Compilar:
make -j 16
Si falla porque necesita el comando python y no esta instalado python-is-python3:
cd $HOME/bin ln -s /usr/bin/python3 python
Luego volver a correr el make.
IMPORTANTE
Para compilar hay que setear opciones en un archivo Config.sh. Estas opciones tienen que ver con parámetros de la aplicación. Hay que averiguar que opciones hay que establecer según el uso del proyecto.
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