Disclaimer: Es necesario tener una licencia de VASP para poder acceder a los archivos fuentes.
Viene incluído en el cluster. Se accede mediante el módulo intel. La versión default es la 2023.2.1.
Viene inluído en el cluster. Luego de cargar el módulo intel, se debe cargar el módulo mpi.
Viene incluído en el cluster. Se accede mediante el módulo intel. La versión default es la 2023.2.1.
Se encuentra en el directorio /data/shared/apps/wannier90.
Descargar de aquí la versión de libxc deseada.
Dentro de un nodo de cómputo:
srun --pty -N 1 -n 1 -c 64 --cpu-bind=none bash
module purge module load intel autotools autoreconf -i ./configure --prefix=/data/shared/apps/libxc/7.0.0/ CC=icc CF=ifort --disable-fhc make -j 64 make install
Al utilizar –disable-fhc los tests de make check fallan. Supuestamente se pueden parchear los tests. Ver issue en gitlab de libxc.
Luego de compilar, libxc se encuentra en el directorio /data/shared/apps/libxc/7.0.0/.
Viene incluído en el cluster. Se accede mediante el módulo hdf5.
# Default precompiler options
CPP_OPTIONS = -DHOST=\"LinuxIFC\" \
-DMPI -DMPI_BLOCK=8000 -Duse_collective \
-DCACHE_SIZE=4000 \
-Davoidalloc \
-Dvasp6 \
-Dtbdyn \
-Dfock_dblbuf \
-D_OPENMP
CPP = fpp -f_com=no -free -w0 $*$(FUFFIX) $*$(SUFFIX) $(CPP_OPTIONS)
FC = mpiifort -qopenmp
FCL = mpiifort
FREE = -free -names lowercase
FFLAGS = -assume byterecl -w
OFLAG = -O2
OFLAG_IN = $(OFLAG)
DEBUG = -O0
# For what used to be vasp.5.lib
CPP_LIB = $(CPP)
FC_LIB = $(FC)
CC_LIB = icc
CFLAGS_LIB = -O
FFLAGS_LIB = -O1
FREE_LIB = $(FREE)
OBJECTS_LIB = linpack_double.o
# For the parser library
CXX_PARS = icpc
LLIBS = -lstdc++
##
## Customize as of this point! Of course you may change the preceding
## part of this file as well if you like, but it should rarely be
## necessary ...
# When compiling on the target machine itself, change this to the
# relevant target when cross-compiling for another architecture
VASP_TARGET_CPU ?= -xHOST
FFLAGS += $(VASP_TARGET_CPU)
# Intel MKL (FFTW, BLAS, LAPACK, and scaLAPACK)
# (Note: for Intel Parallel Studio's MKL use -mkl instead of -qmkl)
FCL += -qmkl
MKLROOT ?= /opt/intel/oneapi/mkl/2023.2.0
LLIBS += -L$(MKLROOT)/lib/intel64 -lmkl_scalapack_lp64 -lmkl_blacs_intelmpi_lp64
INCS += -I$(MKLROOT)/include/fftw
# HDF5-support (optional but strongly recommended, and mandatory for some features)
CPP_OPTIONS += -DVASP_HDF5
HDF5_ROOT ?= /opt/ohpc/pub/libs/intel/hdf5/1.10.8
LLIBS += -L$(HDF5_ROOT)/lib -lhdf5_fortran
INCS += -I$(HDF5_ROOT)/include
# For the VASP-2-Wannier90 interface (optional)
CPP_OPTIONS += -DVASP2WANNIER90
WANNIER90_ROOT ?= /data/shared/apps/wannier90/3.1.0
LLIBS += -L$(WANNIER90_ROOT)/lib -lwannier
# For the fftlib library (hardly any benefit in combination with MKL's FFTs)
#FCL = mpiifort fftlib.o -qmkl
#CXX_FFTLIB = icpc -qopenmp -std=c++11 -DFFTLIB_USE_MKL -DFFTLIB_THREADSAFE
#INCS_FFTLIB = -I./include -I$(MKLROOT)/include/fftw
#LIBS += fftlib
# For libxc
CPP_OPTIONS += -DUSELIBXC
LIBXC_ROOT ?= /data/shared/apps/libxc/6.2.2
LLIBS += -L$(LIBXC_ROOT)/lib -lxcf03 -lxc
INCS += -I$(LIBXC_ROOT)/include
# For machine learning library vaspml (experimental)
#CPP_OPTIONS += -Dlibvaspml
#CPP_OPTIONS += -DVASPML_USE_CBLAS
#CPP_OPTIONS += -DVASPML_USE_MKL
#CPP_OPTIONS += -DVASPML_DEBUG_LEVEL=3
#CXX_ML = mpiicpc -cxx=icpx -qopenmp
#CXXFLAGS_ML = -O3 -std=c++17 -Wall
#INCLUDE_ML =
En un nodo de cómputo:
srun --pty -N 1 -n 1 -c 64 --cpu-bind=none bash
cargar módulos y compilar:
module purge module load intel mpi hdf5 make DEPS=1 -j 64 all