====== Receta de compilación de VASP ====== Disclaimer: Es necesario tener una licencia de VASP para poder acceder a los archivos fuentes. ===== Dependencias ===== ==== Intel OneAPI ==== Viene incluído en el cluster. Se accede mediante el módulo ''intel''. La versión default es la ''2023.2.1''. ==== Intel MPI ==== Viene inluído en el cluster. Luego de cargar el módulo ''intel'', se debe cargar el módulo ''mpi''. ==== Intel MKL ==== Viene incluído en el cluster. Se accede mediante el módulo ''intel''. La versión default es la ''2023.2.1''. ==== Wannier90 ==== Se encuentra en el directorio ''/data/shared/apps/wannier90''. ==== LIBXC ==== [[https://libxc.gitlab.io/|Web oficial de libxc]]. Descargar de [[https://libxc.gitlab.io/download/|aquí]] la versión de libxc deseada. Dentro de un nodo de cómputo: srun --pty -N 1 -n 1 -c 64 --cpu-bind=none bash module purge module load intel autotools autoreconf -i ./configure --prefix=/data/shared/apps/libxc/7.0.0/ CC=icc CF=ifort --disable-fhc make -j 64 make install Al utilizar ''--disable-fhc'' los tests de ''make check'' fallan. Supuestamente se pueden parchear los tests. [[https://gitlab.com/libxc/libxc/-/issues/489| Ver issue en gitlab de libxc]]. Luego de compilar, libxc se encuentra en el directorio ''/data/shared/apps/libxc/7.0.0/''. ==== HDF5 ==== Viene incluído en el cluster. Se accede mediante el módulo ''hdf5''. ===== Compilando VASP ===== ==== makefile.include ==== # Default precompiler options CPP_OPTIONS = -DHOST=\"LinuxIFC\" \ -DMPI -DMPI_BLOCK=8000 -Duse_collective \ -DCACHE_SIZE=4000 \ -Davoidalloc \ -Dvasp6 \ -Dtbdyn \ -Dfock_dblbuf \ -D_OPENMP CPP = fpp -f_com=no -free -w0 $*$(FUFFIX) $*$(SUFFIX) $(CPP_OPTIONS) FC = mpiifort -qopenmp FCL = mpiifort FREE = -free -names lowercase FFLAGS = -assume byterecl -w OFLAG = -O2 OFLAG_IN = $(OFLAG) DEBUG = -O0 # For what used to be vasp.5.lib CPP_LIB = $(CPP) FC_LIB = $(FC) CC_LIB = icc CFLAGS_LIB = -O FFLAGS_LIB = -O1 FREE_LIB = $(FREE) OBJECTS_LIB = linpack_double.o # For the parser library CXX_PARS = icpc LLIBS = -lstdc++ ## ## Customize as of this point! Of course you may change the preceding ## part of this file as well if you like, but it should rarely be ## necessary ... # When compiling on the target machine itself, change this to the # relevant target when cross-compiling for another architecture VASP_TARGET_CPU ?= -xHOST FFLAGS += $(VASP_TARGET_CPU) # Intel MKL (FFTW, BLAS, LAPACK, and scaLAPACK) # (Note: for Intel Parallel Studio's MKL use -mkl instead of -qmkl) FCL += -qmkl MKLROOT ?= /opt/intel/oneapi/mkl/2023.2.0 LLIBS += -L$(MKLROOT)/lib/intel64 -lmkl_scalapack_lp64 -lmkl_blacs_intelmpi_lp64 INCS += -I$(MKLROOT)/include/fftw # HDF5-support (optional but strongly recommended, and mandatory for some features) CPP_OPTIONS += -DVASP_HDF5 HDF5_ROOT ?= /opt/ohpc/pub/libs/intel/hdf5/1.10.8 LLIBS += -L$(HDF5_ROOT)/lib -lhdf5_fortran INCS += -I$(HDF5_ROOT)/include # For the VASP-2-Wannier90 interface (optional) CPP_OPTIONS += -DVASP2WANNIER90 WANNIER90_ROOT ?= /data/shared/apps/wannier90/3.1.0 LLIBS += -L$(WANNIER90_ROOT)/lib -lwannier # For the fftlib library (hardly any benefit in combination with MKL's FFTs) #FCL = mpiifort fftlib.o -qmkl #CXX_FFTLIB = icpc -qopenmp -std=c++11 -DFFTLIB_USE_MKL -DFFTLIB_THREADSAFE #INCS_FFTLIB = -I./include -I$(MKLROOT)/include/fftw #LIBS += fftlib # For libxc CPP_OPTIONS += -DUSELIBXC LIBXC_ROOT ?= /data/shared/apps/libxc/6.2.2 LLIBS += -L$(LIBXC_ROOT)/lib -lxcf03 -lxc INCS += -I$(LIBXC_ROOT)/include # For machine learning library vaspml (experimental) #CPP_OPTIONS += -Dlibvaspml #CPP_OPTIONS += -DVASPML_USE_CBLAS #CPP_OPTIONS += -DVASPML_USE_MKL #CPP_OPTIONS += -DVASPML_DEBUG_LEVEL=3 #CXX_ML = mpiicpc -cxx=icpx -qopenmp #CXXFLAGS_ML = -O3 -std=c++17 -Wall #INCLUDE_ML = En un nodo de cómputo: srun --pty -N 1 -n 1 -c 64 --cpu-bind=none bash cargar módulos y compilar: module purge module load intel mpi hdf5 make DEPS=1 -j 64 all