====== Receta de compilación de VASP ======
Disclaimer: Es necesario tener una licencia de VASP para poder acceder a los archivos fuentes.
===== Dependencias =====
==== Intel OneAPI ====
Viene incluído en el cluster. Se accede mediante el módulo ''intel''. La versión default es la ''2023.2.1''.
==== Intel MPI ====
Viene inluído en el cluster. Luego de cargar el módulo ''intel'', se debe cargar el módulo ''mpi''.
==== Intel MKL ====
Viene incluído en el cluster. Se accede mediante el módulo ''intel''. La versión default es la ''2023.2.1''.
==== Wannier90 ====
Se encuentra en el directorio ''/data/shared/apps/wannier90''.
==== LIBXC ====
[[https://libxc.gitlab.io/|Web oficial de libxc]].
Descargar de [[https://libxc.gitlab.io/download/|aquí]] la versión de libxc deseada.
Dentro de un nodo de cómputo:
srun --pty -N 1 -n 1 -c 64 --cpu-bind=none bash
module purge
module load intel autotools
autoreconf -i
./configure --prefix=/data/shared/apps/libxc/7.0.0/ CC=icc CF=ifort --disable-fhc
make -j 64
make install
Al utilizar ''--disable-fhc'' los tests de ''make check'' fallan. Supuestamente se pueden parchear los tests. [[https://gitlab.com/libxc/libxc/-/issues/489| Ver issue en gitlab de libxc]].
Luego de compilar, libxc se encuentra en el directorio ''/data/shared/apps/libxc/7.0.0/''.
==== HDF5 ====
Viene incluído en el cluster. Se accede mediante el módulo ''hdf5''.
===== Compilando VASP =====
==== makefile.include ====
# Default precompiler options
CPP_OPTIONS = -DHOST=\"LinuxIFC\" \
-DMPI -DMPI_BLOCK=8000 -Duse_collective \
-DCACHE_SIZE=4000 \
-Davoidalloc \
-Dvasp6 \
-Dtbdyn \
-Dfock_dblbuf \
-D_OPENMP
CPP = fpp -f_com=no -free -w0 $*$(FUFFIX) $*$(SUFFIX) $(CPP_OPTIONS)
FC = mpiifort -qopenmp
FCL = mpiifort
FREE = -free -names lowercase
FFLAGS = -assume byterecl -w
OFLAG = -O2
OFLAG_IN = $(OFLAG)
DEBUG = -O0
# For what used to be vasp.5.lib
CPP_LIB = $(CPP)
FC_LIB = $(FC)
CC_LIB = icc
CFLAGS_LIB = -O
FFLAGS_LIB = -O1
FREE_LIB = $(FREE)
OBJECTS_LIB = linpack_double.o
# For the parser library
CXX_PARS = icpc
LLIBS = -lstdc++
##
## Customize as of this point! Of course you may change the preceding
## part of this file as well if you like, but it should rarely be
## necessary ...
# When compiling on the target machine itself, change this to the
# relevant target when cross-compiling for another architecture
VASP_TARGET_CPU ?= -xHOST
FFLAGS += $(VASP_TARGET_CPU)
# Intel MKL (FFTW, BLAS, LAPACK, and scaLAPACK)
# (Note: for Intel Parallel Studio's MKL use -mkl instead of -qmkl)
FCL += -qmkl
MKLROOT ?= /opt/intel/oneapi/mkl/2023.2.0
LLIBS += -L$(MKLROOT)/lib/intel64 -lmkl_scalapack_lp64 -lmkl_blacs_intelmpi_lp64
INCS += -I$(MKLROOT)/include/fftw
# HDF5-support (optional but strongly recommended, and mandatory for some features)
CPP_OPTIONS += -DVASP_HDF5
HDF5_ROOT ?= /opt/ohpc/pub/libs/intel/hdf5/1.10.8
LLIBS += -L$(HDF5_ROOT)/lib -lhdf5_fortran
INCS += -I$(HDF5_ROOT)/include
# For the VASP-2-Wannier90 interface (optional)
CPP_OPTIONS += -DVASP2WANNIER90
WANNIER90_ROOT ?= /data/shared/apps/wannier90/3.1.0
LLIBS += -L$(WANNIER90_ROOT)/lib -lwannier
# For the fftlib library (hardly any benefit in combination with MKL's FFTs)
#FCL = mpiifort fftlib.o -qmkl
#CXX_FFTLIB = icpc -qopenmp -std=c++11 -DFFTLIB_USE_MKL -DFFTLIB_THREADSAFE
#INCS_FFTLIB = -I./include -I$(MKLROOT)/include/fftw
#LIBS += fftlib
# For libxc
CPP_OPTIONS += -DUSELIBXC
LIBXC_ROOT ?= /data/shared/apps/libxc/6.2.2
LLIBS += -L$(LIBXC_ROOT)/lib -lxcf03 -lxc
INCS += -I$(LIBXC_ROOT)/include
# For machine learning library vaspml (experimental)
#CPP_OPTIONS += -Dlibvaspml
#CPP_OPTIONS += -DVASPML_USE_CBLAS
#CPP_OPTIONS += -DVASPML_USE_MKL
#CPP_OPTIONS += -DVASPML_DEBUG_LEVEL=3
#CXX_ML = mpiicpc -cxx=icpx -qopenmp
#CXXFLAGS_ML = -O3 -std=c++17 -Wall
#INCLUDE_ML =
En un nodo de cómputo:
srun --pty -N 1 -n 1 -c 64 --cpu-bind=none bash
cargar módulos y compilar:
module purge
module load intel mpi hdf5
make DEPS=1 -j 64 all